Sledovacie prvky zahŕňajú bór, zinok, molybdén, železo, mangán, meď a ďalšie živiny. Aj keď je dopyt rastlín po stopových prvkoch malý, ich úloha v raste a rozvoji rastlín je rovnako dôležitá ako po makroelementoch, keď je určitý stopový prvok nedostatočný, rast a rozvoj plodín je významne ovplyvnený, výťažok sa zníži a kvalita sa zníži. Na druhej strane, príliš veľa stopových prvkov môže otráviť plodiny, ovplyvniť výnos a kvalitu a dokonca ohroziť zdravie ľudí a zvierat v ťažkých prípadoch. Pri neustálom zlepšovaní výťažku plodín a veľkej aplikácii chemických hnojív je aplikácia hnojív stopových prvkov postupne naliehavá. V hnojivách stopových prvkov sa zvyčajne používajú železo, mangán, zinok, síran medi, kyselina boritá, kyselina molybdatát a ich monovalentné soli.
